Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms