Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED9Q6R2W3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms