Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms