Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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NCF4Q15080 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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NCF4Q15080 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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NCF4Q15080 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NCF4Q15080 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NCF4Q15080 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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