Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms