Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms