Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms