Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms