Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRAP18433 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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