Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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