Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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C4orf47A7E2U8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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C4orf47A7E2U8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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C4orf47A7E2U8 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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C4orf47A7E2U8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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C4orf47A7E2U8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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C4orf47A7E2U8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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C4orf47A7E2U8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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C4orf47A7E2U8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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