Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCK2Q16822 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms