Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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BRD3Q15059 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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BRD3Q15059 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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BRD3Q15059 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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BRD3Q15059 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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BRD3Q15059 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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BRD3Q15059 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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BRD3Q15059 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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