Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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