Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms