Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms