Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms