Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms