Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms