Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KLF12Q9Y4X4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms