Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms