Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms