Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM48Q8IWZ4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms