Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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TNS3Q68CZ2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNS3Q68CZ2 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
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TNS3Q68CZ2 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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TNS3Q68CZ2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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TNS3Q68CZ2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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TNS3Q68CZ2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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TNS3Q68CZ2 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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TNS3Q68CZ2 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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TNS3Q68CZ2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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TNS3Q68CZ2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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TNS3Q68CZ2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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TNS3Q68CZ2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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TNS3Q68CZ2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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TNS3Q68CZ2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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TNS3Q68CZ2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNS3Q68CZ2 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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