Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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