Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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