Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA3Q08378 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms