Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SETD4-203ENST00000399205 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC005224.1-201ENST00000458492 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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