Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms