Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD27P26842 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD27P26842 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms