Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTSSP25774 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTSSP25774 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTSSP25774 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTSSP25774 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTSSP25774 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTSSP25774 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CTSSP25774 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CTSSP25774 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CTSSP25774 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTSSP25774 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTSSP25774 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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CTSSP25774 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CTSSP25774 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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CTSSP25774 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTSSP25774 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CTSSP25774 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTSSP25774 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTSSP25774 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTSSP25774 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTSSP25774 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTSSP25774 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTSSP25774 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSSP25774 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSSP25774 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSSP25774 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSSP25774 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSSP25774 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSSP25774 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSSP25774 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSSP25774 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSSP25774 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSSP25774 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSSP25774 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSSP25774 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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