Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD6O43541 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms