Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms