Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AGAP5A6NIR3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms