Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms