Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga6Q61739 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms