Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GEN1Q17RS7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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