Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms