Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SIX1Q15475 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SIX1Q15475 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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SIX1Q15475 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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