Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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