Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms