Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms