Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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