Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSDA5PKW4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms