Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DCAF1Q9Y4B6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DCAF1Q9Y4B6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DCAF1Q9Y4B6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DCAF1Q9Y4B6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
DCAF1Q9Y4B6 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DCAF1Q9Y4B6 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DCAF1Q9Y4B6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DCAF1Q9Y4B6 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DCAF1Q9Y4B6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DCAF1Q9Y4B6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCAF1Q9Y4B6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms