Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.3 ms