Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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