Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM56Q9BRZ2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM56Q9BRZ2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms