Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms