Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS3Q8IXF0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms